Een paar generaties na het bewind van Caesar zijn apen de dominante soort en leven ze harmonieus, terwijl mensen zijn teruggebracht tot een leven in de schaduw. Terwijl een nieuwe tirannieke aapleider zijn imperium opbouwt, onderneemt een jonge aap een aangrijpende reis die ervoor zorgt dat hij alles wat hij over het verleden weet in twijfel trekt en keuzes maakt die de toekomst voor zowel apen als mensen zal bepalen.