Baby Daddy gaat over Ben, z'n maatje Tucker en z'n broer Danny. Hun leven wordt opgeschud als ze bij thuiskomst een baby aantreffen bij de voordeur, daar achtergelaten door een ex-vriendin van Ben. Na langdurig overleg besluit Ben de baby groot te brengen met de hulp van z'n vrienden, z'n beschermende en soms bazige moeder, Bonnie, en z'n goede vriendin Riley, die al vanaf hun jeugd stiekem verliefd op hem is. Riley hoopt dat Ben dat eindelijk zal zien, maar ze beseft niet dat Bens broer Danny eigenlijk verliefd is op haar.