De poppenhuizen in het Rijksmuseum zijn alleen om naar te kijken. Voor sommige medewerkers is er een uitzondering gemaakt. Zij mogen in deze aflevering van Geheimen van het Museum een van de poppenhuizen onderzoeken en krijgen hiervoor toegang tot een bijzondere ruimte.

Restaurator Tirza wil in Geheimen van het Museum meer weten over de William Rex, het grootste modelschip uit de collectie van het museum. Ze roept hiervoor de hulp in van een endoscopist, die voor het eerst de binnenkant van de William Rex filmt.

Conservatoren van het Rijksmuseum geven in de nieuwe reeks Geheimen van het Museum een kijkje achter de schermen. Ditmaal vertellen ze onder meer over de verhuizing naar Parijs van Rembrandts huwelijksportretten van Marten en Oopjen.